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中国水产学会是由水产及与水产有关的科技工作者自愿组成并依法登记的全国性、学术性、非营利性社会组织,也是党和政府联系广大水产科技工作者的桥梁和纽带,以及国家发展水产科学技术事业的重要社会力量,旨在以经济建设为中心,坚持科学技术是第一生产力的思想,实施科教兴国战略、人才强国和可持续发展战略,促进水产科学技术的普及和推广,促进水产科技人才的成长和素质提高,促进水产科学技术与经济的结合,促进水产科学技术的繁荣与发展,为加速实现我国渔业现代化建设目标做出贡献。中国水产学会的最高权力机构是全国会员代表大会。理事会是全国会员代表大会的执行机构;秘书处是负责处理本会日常事务的办事机构,下设办公室、学术交流处、科普处、渔业信息咨询处和渔业战略发展研究中心五个处室。学会下设淡水养殖分会、海水养殖分会、鲑鱼类专业委员会、观赏鱼分会、水产动物营养与饲料专业委员会、鱼病专业委员会、渔药专业委员会、水产生物技术专业委员会、渔业资源与环境分会、水产捕捞分会、水产品加工和综合利用分会、渔业制冷专业委员会、渔业装备专业委员会、渔业工程专业委员会、渔业信息与渔业经济分会、水产名词审定工作委员会、科普工作委员会等17个分会和专业委员会。
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